水稻恶苗病又称公秧，从苗期到抽穗期均可发生。恶苗病菌寄生或附着在种子上，种子带菌是恶苗病发病的主要原因。重病种子往往不能发芽，或萌发后不久幼苗即可死亡。轻病的种子长出的病苗徒长，比健株高出1/3，植株细弱，全株呈黄绿色，根系发育不良，部分病苗在插秧前后死亡。
    成株期一般在插秧后一月左右出现病株，病状与苗期相似，病株分蘖少或不分蘖，节间显著伸长，下部几个茎节上生有许多倒生的不定根，稻秆内生有白色的霉物，后变成淡红色，有时是黑色的小点。病株抽穗后剑叶开张角度比正常株大。重病在孕穗期枯死，轻病常提早抽穗，穗形短小籽粒不实。天气潮湿时，在枯死病株的叶鞘上长淡红色或白色霉状物。病粒谷壳的内外颖合缝处，着生有浅红色霉层。
    发病规律和传播途径水稻恶苗病的病菌在谷粒和稻草上越冬，次年使用了带病的种子或稻草，病菌就会从秧苗的芽鞘或伤口侵入，引起秧苗发病徒长。带病的秧苗移栽后，把病菌带到大田，引起稻苗发病。当水稻抽穗开花时，病菌经风雨传到花器上，使谷粒和稻草带病菌，循环侵染为害水稻。 
防治措施：
    防治水稻恶苗病重点放在种子上入手。 
    一是建立无病留种田：留种田应选择无病或发病轻的田块，单打单收。
    二是种子要做到严格消毒。用50%的多菌灵100克，加水50公斤浸种；或35%的恶苗灵120克，对水50公斤浸种40公斤；或25%施保克、25%使百克、25%菌威均为同一类药剂，分别用10毫升对水50公斤浸稻种40公斤，浸种时间不低于48小时。药液浸种必须注意的是，液面一定要高出种子层面15~20厘米，供种子吸收。同时，在浸种过程中，药液面保持静止状态，中途不能搅拌，也不能重复使用，以保证闷死病菌。 
    三是发现病株及时拔除。不管是在秧田还是大田里，发现病株应及时拔掉，防止扩大侵染。
    四是对于病植株稻草进行处理。妥善处理病稻草，不能随便乱扔，也不能堆放在田边地头，不能作种子催芽的覆盖物，不能用来捆扎秧把，可集中高温堆沤，严重的用火烧。